序一序二序三总论伤寒热病总论验舌色论验口唇论验二便论辨脉论南北方宜发表不同论南北方宜清里相同论三阴经热病论三阴经寒病论阴症似阳论阳症似阴论宜发表论忌发表论宜清里论忌清里论宜和解论忌和解论宜吐法论忌吐法
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序张序卷上卷上后藤艮山北山友松和田东郭荻野台洲华冈青洲卷下永富独啸庵惠美宁固福岛慎独轩田中适所福井枫亭高端枳园多纪桂山多纪庭黄跋书《先哲医话》后
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类中肝风眩晕头痛咳嗽吐血失音肺痿虚劳遗精淋浊尿血小便闭癃
《黄帝内经》简介重广补注黄帝内经素问序《黄帝内经·素问》上古天真论篇第一四气调神大论篇第二生气通天论篇第三金匮真言论篇第四阴阳应象大论篇第五阴阳离合篇第六阴阳别论篇第七灵兰秘典论篇第八六节藏象论篇第九
简介普济方有关说明卷一 方脉总论 辨男女形生神毓论卷二 方脉总论 辨奇经八脉法卷三 方脉总论 辨七表八里脉法卷四 方脉总论 九道病脉卷五 方脉药性总论 药性总论卷六 五运六气图卷七 运气图 甲子岁图卷
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
程门雪遗稿
阴阳五行阴阳阳常有余，阴常不足阳化气，阴成形阳气阳强不能密，阴气乃绝阳杀阴藏阳生阴长阳生于阴阳胜则阴病阳损及阴阳中之阳阳中之阴阴不抱阳阴平阳秘阴气阴生于阳阴胜则阳病阴损及阳阴阳阴阳乖戾阴阳互根阴阳离决