首序自序性命篇上性命篇下补遗篇一补遗篇二辟邪篇太极图说注解序周子太极图（缺）无极而太极后跋
编写说明导言一、干支配属（一）天干的阴阳五行属性与方位（二）天干配属脏腑经络与五季（三）天干配属五运（四）地支纪月与所属四季（五）地支所属阴阳五行（六）地支配合时间与脏腑经络二、年、月、日、时干支掌上
自叙绪说卷一石膏赤石脂硝石、芒硝甘草黄人参沙参桔梗知母白术黄连黄芩柴胡白藓皮龙胆芍药牡丹卷二木香补骨脂姜黄、郁金荆芥薄荷青蒿夏枯草漏芦麻黄麦门冬瞿麦葶苈车前子蓄大黄附子、天雄、乌头半夏荛花菟丝子五味子
序上卷本症治法兼症治法变症治法疠疡类症本症治验类症治验中卷续治诸症下卷各症方药
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
周选堂（着）序一：李序序二：章序序三：徐序编者的话卷一 冬伤于寒春必病温大意一、概述二、分述（一）春温（二）风温（三）温病（四）温毒（五）晚发选按三、拟用诸法（一）辛温解表法（二）凉解里热法（三）清热
第一册卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳发热潮热恶寒往来寒热外热内寒，外寒内热上热下寒，上寒下热疟厥第二册气郁痞水肿胀满积聚痰饮咳嗽喘短气第三册呕吐膈气呕吐反胃噎吐
赠万密斋先生医书序叙叙万氏幼科源流卷之一总论大法附方卷之二背图形八症（一）？脑发？腮上背发中背发下背发腰背发暗发（骑马痈）卷之三背图形八症（二）对口正背发上搭手中搭手囊发蛇头疔蛇头疔天蛇头毒膝发卷之四
叙卷上诊法常以平旦望色常宜定静明堂周身部位明堂六部提纲面貌分应脏腑五官分应五脏五色分应五脏相气十法提纲望法阴阳总纲五色相应提纲五色主病提纲部色主病提纲四时望法相参四时气色主病昼夜阴晴相参五方望法相参气
伤寒琐言序明理续论序刻陶节《伤寒六书》序伤寒琐言卷之一辩张仲景伤寒论治伤寒用药大略伤寒言证不言病厥分寒热辩伤寒用浮中沉三脉法浮中沉伤寒传足不传手经辩结胸解伤寒寒热论论伤寒少阴病发热而反用药不同论伤寒两