序卷上一、道生二、阴阳六十四卦、方圆二图三、色诊四、脉诊五、藏象卷下一、经络二、治则三、病能
原叙卷上咽喉说喉科总论诸风秘论阴阳论辨面色论坏症须知论证附：纂咽喉不治症喉风三十六症斗底风叉喉风咽疮风鱼鳞风双松子风单松子风帝中风双鹅风单鹅风双燕口风单燕口风重风木舌风重舌风坐舌莲花风合架风角架风爆骨
序卷上辨阴证阳证辨脉辨寒热辨外感八风之邪辨手心手背辨口鼻辨气少气盛辨头痛辨筋骨四肢辨外伤不恶食辨渴与不渴辨劳役受病表虚不作表实治之辨证与中热颇相似卷中饮食劳倦论补中益气汤立方本指朱砂安神丸四时用药加减
注序补注《明医杂着》序卷之一仲景东垣河间丹溪诸书孰优处方药品多少论异法方宜论丹溪治病不出乎气血痰郁产后发热伤寒时气病后调养泄泻劳热饮食劳倦内伤发热伤寒发热伤暑发热病有感伤中心腹疼痛病时静心息虑发热论补
总论各论温病大纲逆传入营流连气分邪留三焦里结阳明卫、气、营、血看法论湿邪察舌白苔黄苔绛舌紫舌淡红舌黑苔验齿辨斑疹辨白疹论妇人温病
序卷上疮科总论五发痈疽论五发痈疽通治方疔疮论瘰论卷下肠痈痔论乳痈论肺痈论诸疳疮论附骨疽论诸疮论疥癣论瘿瘤论疮论便毒论
自序集之一·初生门证治通论钱氏论五脏所主五脏病五脏相胜洁古论五脏五邪相乘补泻大法五脏补泻法察色听声脉法死证襁褓乳哺乳儿法乳令儿病证哺儿法断乳法杂将护法集之一·初生门初生拭口法浴儿法断脐法灸脐法裹脐法服
序序医家源流卷之上评脉（一）察视（二）五脏（三）汗吐下温水火刺灸八法（四）五脏虚实(五)五脏绝死（六）脉（七）周身经穴（八）伤寒（九）六经（十）时行疫疠（十一）湿（十二）寒热往来（十三）恶寒（十四）背
序卷一初诞法护养法噤风撮口脐风脉法变蒸肝脏心脏脾脏肺脏肾脏卷二面上症发搐目睛动唇口蠕动惊搐目直睡中惊动目动咬牙摇头便血偏风口噤角弓反张卷三急惊慢惊惊痫惊风天钓内钓盘肠气痛胎惊胎风五软五硬卷四风热风症痉
自序小序凡例卷之一冬伤于寒春必病温大意春温风温温病温毒晚发拟用诸法备用成方临证治案卷之二春伤于风大意伤风冒风中风风寒风热风湿寒疫拟用诸法备用成方临证治案卷之三春伤于风夏生飧泄大意飧泄洞泄寒泻火泻暑泻湿