卷第一孔志约序梁·陶隐居序合药分剂料理法卷第二诸病通用药疗风通用风眩头面风中风脚弱久风湿痹贼风挛痛暴风瘙痒伤寒大热劳复温疟中恶霍乱转筋呕大腹水肿肠下痢大便不通小便淋小便利溺血消渴黄胆上气咳嗽呕吐痰饮宿
治法总论用药歌血头行走穴道歌左右论药中禁忌穴名药名全身门第一头面门第二身中门第三脊背门第四腿足门第五金创门第六杖伤附通用门第七跌损妙方书后谨跋
序自序卷之上脉法脉诀歌金匮解（方附本条）逐月养胎辨并慎择医药论受胎试验法（附方）试男女胎法三禁教养宜忌论饮食七情禁忌论妊娠药忌歌种子补益受胎寿子论胎动安胎论恶阻论胞漏并小产论诸痛论（附孕痈）胎逆上逼胀
养生肤语
自序小序凡例卷之一冬伤于寒春必病温大意春温风温温病温毒晚发拟用诸法备用成方临证治案卷之二春伤于风大意伤风冒风中风风寒风热风湿寒疫拟用诸法备用成方临证治案卷之三春伤于风夏生飧泄大意飧泄洞泄寒泻火泻暑泻湿
初生沐浴噤风撮口脐风气闭啼伤风咳嗽疟吐吐泻霍乱积痢疳肿胀惊风惊风死症歌脉法慢惊慢脾风毒惊瘫鹤膝候痫腹痛虫心痛咽喉暑脱肛热黄胆淋症（附白尿）眼目赤肿痧疹
黄庭内景五藏六府图
第1部分第2部分第3部分
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
劝读十则